Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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TRAF1Q13077 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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TRAF1Q13077 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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TRAF1Q13077 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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TRAF1Q13077 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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TRAF1Q13077 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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TRAF1Q13077 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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TRAF1Q13077 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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