Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMAGPQ0VAQ4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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