Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD300CQ08708 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms