Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms