Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms