Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DEFA6Q01524 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DEFA6Q01524 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms