Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK6Q00534 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms