Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRX1P78414 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRX1P78414 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms