Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIMK2P53671 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms