Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCR4P51679 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCR4P51679 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms