Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD34P28906 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD34P28906 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD34P28906 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD34P28906 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms