Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERBB3P21860 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms