Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEFHP12036 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEFHP12036 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEFHP12036 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEFHP12036 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEFHP12036 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEFHP12036 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEFHP12036 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEFHP12036 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEFHP12036 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEFHP12036 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEFHP12036 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEFHP12036 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEFHP12036 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEFHP12036 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms