Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRPRAP08240 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRPRAP08240 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms