Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms