Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRRTM2O43300 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms