Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD28O15084 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms