Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHMG1C9JSJ3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms