Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms