Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
KDM2AQ9Y2K7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM2AQ9Y2K7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms