Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PCDHA12Q9UN75 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCDHA12Q9UN75 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms