Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS2Q9NYR9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms