Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA2D2Q9NY47 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA2D2Q9NY47 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA2D2Q9NY47 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA2D2Q9NY47 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA2D2Q9NY47 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA2D2Q9NY47 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA2D2Q9NY47 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms