Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD3Q9NX63 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms