Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms