Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
BIN3Q9NQY0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BIN3Q9NQY0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms