Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARFGAP3Q9NP61 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.8 ms