Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC52A2Q9HAB3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms