Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLIRPQ9GZT3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms