Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC63Q8NA47 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC63Q8NA47 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms