Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC117Q8IWD4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC117Q8IWD4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms