Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME9Q86XW9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME9Q86XW9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME9Q86XW9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME9Q86XW9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME9Q86XW9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME9Q86XW9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME9Q86XW9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME9Q86XW9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NME9Q86XW9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME9Q86XW9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME9Q86XW9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NME9Q86XW9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms