Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNTB1Q13884 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms