Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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