Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTR4Q13639 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HTR4Q13639 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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