Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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CDK5R2Q13319 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CDK5R2Q13319 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CDK5R2Q13319 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CDK5R2Q13319 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CDK5R2Q13319 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK5R2Q13319 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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