Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms