Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GTF3C1Q12789 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF3C1Q12789 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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