Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms