Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms