Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKL1Q00532 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms