Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX1P83916 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX1P83916 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX1P83916 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX1P83916 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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