Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms