Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA3P59666 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms