Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN15P56746 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms