Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms