Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CASQ1P31415 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms