Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5DP30049 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms