Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF4P23510 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms