Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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RPS6KB1P23443 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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RPS6KB1P23443 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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RPS6KB1P23443 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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RPS6KB1P23443 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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RPS6KB1P23443 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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RPS6KB1P23443 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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RPS6KB1P23443 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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RPS6KB1P23443 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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RPS6KB1P23443 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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RPS6KB1P23443 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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RPS6KB1P23443 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RPS6KB1P23443 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RPS6KB1P23443 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RPS6KB1P23443 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPS6KB1P23443 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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